Caratterizzazione genetica e genomica.
Sono realizzate attività di genotipizzazione dei seguenti soggetti:
1) TORI ABILITATI ALLA F.A.:
Attraverso la genotipizzazione con il chip Geneseek GGP-HO dei tori abilitati alla F.A. negli ultimi 2 anni è ultimata la costituzione della popolazione di riferimento da utilizzare per la stima degli effetti degli SNP e delle relative validazioni. Questo consente di valutare le possibilità di miglioramento nell'efficienza della selezione offerte dall'utilizzo della genomica su una vasta gamma di caratteri, primo dei quali sarà la facilità di parto. Utilizzando le stesse genotipizzazioni saranno calcolate le parentele genomiche tra i tori selezionati che saranno confrontate con le parentele attese in base ai pedigree.
2) VITELLI TESTATI AL CENTRO GENETICO
La genotipizzazione di tutti i soggetti sottoposti a prova di performance in stazione di controllo con il chip Geneseek GGP-HO permette di passare rapidamente alla fase applicativa, incorporando le valutazioni genomiche nel sistema di valutazioni genetiche tradizionali ed utilizzando gli indici genomici GEBV per la selezione degli animali, ma anche per il monitoraggio dell'imparentamento tra i soggetti. Al contempo è possibile creare una popolazione di riferimento costituita dai soggetti testati in stazione di controllo per la stima degli effetti degli SNP su tutti i nuovi caratteri che si prevede di iniziare a misurare in stazione, in particolare i fenotipi relativi ad efficienza alimentare, ingestione ed emissioni.
3) TORELLI DI MONTA NATURALE
E' effettuata la genotipizzazione di tutti i tori abilitati annualmente per la monta naturale con chip a bassa densità Geneseek GGP-LO, in modo da poterne calcolare indici genomici GEBV per la facilità di parto più accurati degli indici pedigree attualmente disponibili.
4) MADRI DEI VITELLI TESTATI IN CENTRO GENETICO E DEI TORELLI DI MONTA NATURALE
All'interno del progetto è inoltre prevista la genotipizzazione con chip a bassa densità Geneseek GGP-LO delle madri dei torelli testati in stazione di controllo e di un campione rappresentativo di bovine scelte nella popolazione ogni anno. L'inclusione delle femmine genotipizzate nella popolazione di riferimento consente di aumentare l'accuratezza delle predizioni genomiche per la facilità di parto e può costituire uno strumento per lo sviluppo di servizi ad hoc per la scelta della rimonta a livello aziendale.
5) VITELLI AFFETTI DA MACROGLOSSIA ED ARTROGRIFOSI
Si sta effettuando la genotipizzazione con il chip Geneseek GGP-HO di un campione costituito da 15 vitelli affetti da macroglossia e 15 affetti da artrogrifosi da utilizzarsi per la ricerca di marcatori associati alla manifestazione dei due difetti.